HMI Cabang Sleman dapat dikatakan merupakan cabang baru di lingkungan HMI (MPO). Berdirinya HMI Cabang Sleman tidak bisa dipisahkan dari HMI Cabang Yogyakarta, pada tahun 2000-an dengan alasan perkaderan sebagian kader dari HMI KOrkom UGM mencoba untuk mendirikan cabang HMI yang baru di wilayah Yogyakarta, awalnya bernama HMI Cabang Yogyakarta Barat. Namun ternyata gayung tidak bersambut dari PB HMI, cabang baru tersebut tidak diakui. Usaha yang dilakukan akhirnya baru mendapat respon pada tahun 2004, dengan diakuinya HMI Cabang Sleman (menggantikan nama HMI Cabang Yogyakarta Barat.
Sekretariat pertama HMI Cabang Sleman berada di Jl Kinanti, sebelah utara eks Gedung Registrasi UGM yang kemudian pindah ke Karanggayam, di Jl Gadung no.78 dan pada tahun 2012 pindah kembali ke Pogungrejo No.375, Rt 13 Rw 51, Sinduadi, Mlati , Sleman hingga kini. Dinamika yang terjadi di tubuh HMI Cabang Sleman juga mengakibatkan tumbuh kembangnya komisariat-komisariat yang berada di bawahnya. Tercatat setidaknya terdapat 2 komisariat yang cukup besar, yakni HMI Komisariat Fakultas Kehutanan UGM dan HMI Komisariat Fakultas Ekonomika dan Bisnis UGM. Sedangakan 4 komisariat lainnya merupakan komisariat yang tidak terlalu dominan , antara lain :
1. HMI Komisariat Fakultas Kedokteran Hewan dan Peternakan UGM
2. HMI Komisariat Fakultas Pertanian UGM
3. HMI Komisariat FISIPOL UGM
4. HMI Komisariat Fakultas Teknik dan MIPA UGM